1、缺铁。如果是叶脉变黄那可能是柠檬树体内缺少铁元素。可以适当的补充一些含铁的肥料，就能有很好的改善效果。如果是叶肉变黄，那可能是因为叶子体内缺氮，补充一些氮肥就行。
2、营养不良。当营养不良也会导致柠檬树在开花后叶子泛黄掉叶子。柠檬树根部生长衰弱，无法吸収充足的养分，可以大量施用一些有机肥，使根部更发达，吸収充足的养分来达到生长发育所需要。
3、根部腐烂。如果根部腐烂也会使柠檬树叶子发黄，可能是盆内积水过多，或者施肥过多引起的。可以将腐烂的部位用刀刮干净，然后改良土壤，使土层深厚，土质肥沃，待柠檬树伤口愈合再重新埋入土中。
4、虫害。如果病虫太多，也会导致柠檬树叶子发黄，可以人工驱虫或者喷洒一些除虫剂。使用药剂时要注意，不要中途停用，7～10天之间可喷1次，连续喷洒3～4天后可抑制病虫。